Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Trappc6bQ9D289 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc6bQ9D289 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms