Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nol3Q9D1X0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nol3Q9D1X0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms