Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1I5

Mcee, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MceeQ9D1I5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MceeQ9D1I5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms