Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D1F3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D1F3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D1F3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D1F3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D1F3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D1F3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D1F3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D1F3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms