Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lsm12Q9D0R8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Lsm12Q9D0R8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms