Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf2e1Q9D0D5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf2e1Q9D0D5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms