Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT6

Cmss1, Protein CMSS1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmss1Q9CZT6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cmss1Q9CZT6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms