Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc77Q9CZH8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc77Q9CZH8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms