Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Med4Q9CQA5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Med4Q9CQA5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms