Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Use1Q9CQ56 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Use1Q9CQ56 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Use1Q9CQ56 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Use1Q9CQ56 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Use1Q9CQ56 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Use1Q9CQ56 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Use1Q9CQ56 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Use1Q9CQ56 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Use1Q9CQ56 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Use1Q9CQ56 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Use1Q9CQ56 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Use1Q9CQ56 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Use1Q9CQ56 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Use1Q9CQ56 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Use1Q9CQ56 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Use1Q9CQ56 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Use1Q9CQ56 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Use1Q9CQ56 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Use1Q9CQ56 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Use1Q9CQ56 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms