Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ncbp2Q9CQ49 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ncbp2Q9CQ49 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms