Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn6Q99PL6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn6Q99PL6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn6Q99PL6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ubxn6Q99PL6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ubxn6Q99PL6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms