Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI8

Rtn4r, Reticulon-4 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rQ99PI8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtn4rQ99PI8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms