Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms