Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NsmfQ99NF2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
NsmfQ99NF2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms