Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pcgf6Q99NA9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcgf6Q99NA9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms