Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rnf17Q99MV7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rnf17Q99MV7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
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