Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms