Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp16Q99LG0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp16Q99LG0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms