Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nmd3Q99L48 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nmd3Q99L48 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms