Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ubxn2aQ99KJ0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ubxn2aQ99KJ0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ubxn2aQ99KJ0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2aQ99KJ0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2aQ99KJ0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2aQ99KJ0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2aQ99KJ0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2aQ99KJ0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ubxn2aQ99KJ0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms