Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmed9Q99KF1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tmed9Q99KF1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms