Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlgn1Q99K10 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms