Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TrabdQ99JY4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TrabdQ99JY4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
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