Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pacsin3Q99JB8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pacsin3Q99JB8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms