Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ophn1Q99J31 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ophn1Q99J31 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms