Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smim11aQ99J19 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms