Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf112Q96DY5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms