Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SptssbQ925E8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SptssbQ925E8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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