Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Letmd1Q924L1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms