Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Csmd1Q923L3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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