Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NifkQ91VE6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NifkQ91VE6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms