Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDQ9

Kri1, Protein KRI1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kri1Q8VDQ9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kri1Q8VDQ9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kri1Q8VDQ9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kri1Q8VDQ9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Kri1Q8VDQ9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kri1Q8VDQ9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms