Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ubxn4Q8VCH8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ubxn4Q8VCH8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms