Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W5

Tsen15, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen15, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsen15Q8R3W5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tsen15Q8R3W5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tsen15Q8R3W5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms