Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc12Q8R344 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc12Q8R344 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms