Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Rdh16f2Q8K3M1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Rdh16f2Q8K3M1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Rdh16f2Q8K3M1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Rdh16f2Q8K3M1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Rdh16f2Q8K3M1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Rdh16f2Q8K3M1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Rdh16f2Q8K3M1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rdh16f2Q8K3M1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rdh16f2Q8K3M1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Rdh16f2Q8K3M1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rdh16f2Q8K3M1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rdh16f2Q8K3M1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Rdh16f2Q8K3M1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Rdh16f2Q8K3M1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Rdh16f2Q8K3M1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rdh16f2Q8K3M1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Rdh16f2Q8K3M1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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