Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Prkd3Q8K1Y2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Prkd3Q8K1Y2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms