Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cpne5Q8JZW4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms