Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx8Q8CFD4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx8Q8CFD4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx8Q8CFD4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx8Q8CFD4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx8Q8CFD4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx8Q8CFD4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx8Q8CFD4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx8Q8CFD4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx8Q8CFD4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx8Q8CFD4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx8Q8CFD4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Snx8Q8CFD4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx8Q8CFD4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms