Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDW1

Fam228a, Protein FAM228A, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228aQ8CDW1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam228aQ8CDW1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam228aQ8CDW1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam228aQ8CDW1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam228aQ8CDW1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam228aQ8CDW1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms