Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col6a6Q8C6K9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Col6a6Q8C6K9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms