Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Apol7cQ8C6E1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms