Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb2Q8C5Z3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb2Q8C5Z3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb2Q8C5Z3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb2Q8C5Z3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb2Q8C5Z3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb2Q8C5Z3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb2Q8C5Z3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb2Q8C5Z3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb2Q8C5Z3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb2Q8C5Z3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb2Q8C5Z3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssxb2Q8C5Z3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssxb2Q8C5Z3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms