Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ubqln3Q8C5U9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubqln3Q8C5U9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.6 ms