Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnot2Q8C5L3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms