Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms