Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fndc9Q8BJN4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms