Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gabra5Q8BHJ7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms