Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrtm2Q8BGA3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrtm2Q8BGA3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms